Los ministerios de Economía y de Agricultura de México hicieron saber que no comparten "la determinación" pues consideran que "las medidas cuestionadas están alienadas con los principios de protección a la salud pública y los derechos de los pueblos indígenas establecidos en las leyes locales y los tratados internacionales. Pese a estos argumentos, un comunicado conjunto de ambas carteras indicó que respetará el veredicto del panel, que marca una derrota en una batalla crucial, estimando que "el sistema de solución de controversias del T-MEC es una pieza clave de dicho tratado".
México dispondrá de 45 días para cumplir con las medidas de levantar la prohibición de uso de maíz transgénico en la harina y masa para la elaboración de tortillas, el alimento básico de la dieta en este país, alegando que "no estaba basada en la ciencia y violaba los compromisos" establecidos en el acuerdo trilateral. Washington había solicitado el panel de resolución de controversias tras un desacuerdo sobre la medida adoptada por México de impedir el uso de maíz genéticamente modificado, al considerar que es anticientífico y "socava el acceso al mercado". La Oficina del Representante Comercial de Estados Unidos dio a conocer el veredicto y reveló que el panel "estuvo de acuerdo" con la posición estadounidense en siete reclamaciones legales.
El secretario de Agricultura de ese país Tom Vilsack dijo que la prohibición del maíz transgénico "contradice décadas de evidencia que demuestra la seguridad de la biotecnología agrícola".
El sector privado, en la voz de Juan Carlos Anaya, director general del Grupo Consultor de Mercados Agrícolas, señaló que la resolución establece que, aunque "México buscó proteger la biodiversidad y la salud pública, no cumplió con las normas científicas y comerciales internacionales" contempladas en el T-MEC.
Ahora, México tendrá que permitir la importación de maíz transgénico para consumo animal e industrial pero puede mantener la prohibición de siembra de ese cereal en su territorio, pues el panel sólo regula la importación. Gabriela Siller, del Grupo Financiero Base, dijo que más adelante se conocerán las sanciones para compensar a productores por limitar su acceso al mercado mexicano. Analistas consideran que se trata de una resolución esperada que dividió también a miembros del gabinete presidencial, enfrentando en especial al ministro de Agricultura Marcelo Ebrard con el de Agricultura Julio Berdegué, pues éste favorece levantar la prohibición también de la siembra de maíz modificado genéticamente y aquél se opone. Entre enero y octubre de 2024, Estados Unidos exportó 4.800 millones de dólares en maíz a México, el mayor mercado de exportación de este grano de Estados Unidos. En febrero de 2023, el gobierno decretó la prohibición de maíz transgénico en la elaboración de masa y tortillas e instruyó a las agencias gubernamentales para eliminar gradualmente el uso de maíz transgénico para otros usos alimentarios y en animales.
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